Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NficP70255 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NficP70255 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NficP70255 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NficP70255 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NficP70255 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NficP70255 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NficP70255 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NficP70255 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NficP70255 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
NficP70255 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NficP70255 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NficP70255 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NficP70255 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NficP70255 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NficP70255 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NficP70255 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NficP70255 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NficP70255 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NficP70255 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
NficP70255 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NficP70255 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NficP70255 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
NficP70255 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NficP70255 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NficP70255 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NficP70255 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NficP70255 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NficP70255 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NficP70255 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NficP70255 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NficP70255 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NficP70255 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NficP70255 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NficP70255 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NficP70255 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NficP70255 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NficP70255 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NficP70255 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NficP70255 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NficP70255 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NficP70255 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
NficP70255 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
NficP70255 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NficP70255 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NficP70255 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NficP70255 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NficP70255 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NficP70255 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
NficP70255 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NficP70255 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NficP70255 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NficP70255 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NficP70255 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NficP70255 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NficP70255 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NficP70255 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NficP70255 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NficP70255 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NficP70255 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13□□□□□ -0.33
NficP70255 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NficP70255 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NficP70255 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NficP70255 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NficP70255 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NficP70255 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NficP70255 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NficP70255 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NficP70255 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NficP70255 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NficP70255 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NficP70255 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NficP70255 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NficP70255 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13□□□□□ -0.33
NficP70255 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
NficP70255 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NficP70255 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
NficP70255 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NficP70255 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NficP70255 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NficP70255 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NficP70255 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NficP70255 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NficP70255 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NficP70255 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NficP70255 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NficP70255 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NficP70255 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NficP70255 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
NficP70255 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NficP70255 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NficP70255 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NficP70255 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
NficP70255 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
NficP70255 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NficP70255 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NficP70255 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NficP70255 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NficP70255 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
NficP70255 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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