Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Traf5P70191 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf5P70191 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf5P70191 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf5P70191 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf5P70191 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Traf5P70191 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms