Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vbp1P61759 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms