Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rrp1P56183 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rrp1P56183 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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