Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apobec1P51908 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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