Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TspoP50637 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TspoP50637 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TspoP50637 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TspoP50637 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TspoP50637 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TspoP50637 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TspoP50637 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TspoP50637 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TspoP50637 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TspoP50637 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TspoP50637 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TspoP50637 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TspoP50637 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TspoP50637 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TspoP50637 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TspoP50637 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TspoP50637 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TspoP50637 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TspoP50637 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TspoP50637 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TspoP50637 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TspoP50637 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TspoP50637 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TspoP50637 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TspoP50637 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TspoP50637 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TspoP50637 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TspoP50637 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TspoP50637 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TspoP50637 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TspoP50637 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TspoP50637 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TspoP50637 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TspoP50637 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TspoP50637 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TspoP50637 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TspoP50637 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TspoP50637 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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