Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cdkn1bP46414 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms