Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PtgfrP43117 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms