Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NodalP43021 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NodalP43021 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NodalP43021 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NodalP43021 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NodalP43021 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NodalP43021 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NodalP43021 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NodalP43021 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NodalP43021 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NodalP43021 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NodalP43021 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NodalP43021 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NodalP43021 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NodalP43021 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NodalP43021 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NodalP43021 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NodalP43021 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NodalP43021 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NodalP43021 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NodalP43021 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NodalP43021 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NodalP43021 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NodalP43021 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NodalP43021 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NodalP43021 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NodalP43021 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NodalP43021 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NodalP43021 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NodalP43021 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NodalP43021 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NodalP43021 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
NodalP43021 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NodalP43021 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NodalP43021 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NodalP43021 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NodalP43021 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NodalP43021 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NodalP43021 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NodalP43021 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NodalP43021 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NodalP43021 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NodalP43021 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NodalP43021 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NodalP43021 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NodalP43021 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NodalP43021 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NodalP43021 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NodalP43021 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NodalP43021 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NodalP43021 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NodalP43021 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NodalP43021 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NodalP43021 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NodalP43021 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NodalP43021 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NodalP43021 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NodalP43021 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NodalP43021 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NodalP43021 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NodalP43021 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NodalP43021 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NodalP43021 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NodalP43021 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NodalP43021 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NodalP43021 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NodalP43021 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NodalP43021 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NodalP43021 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NodalP43021 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NodalP43021 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NodalP43021 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NodalP43021 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NodalP43021 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NodalP43021 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NodalP43021 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NodalP43021 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NodalP43021 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NodalP43021 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NodalP43021 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NodalP43021 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NodalP43021 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NodalP43021 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NodalP43021 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NodalP43021 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NodalP43021 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NodalP43021 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NodalP43021 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NodalP43021 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NodalP43021 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NodalP43021 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NodalP43021 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NodalP43021 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NodalP43021 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NodalP43021 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NodalP43021 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NodalP43021 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NodalP43021 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NodalP43021 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NodalP43021 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms