Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprkP35822 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprkP35822 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprkP35822 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprkP35822 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprkP35822 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprkP35822 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtprkP35822 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprkP35822 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprkP35822 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprkP35822 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprkP35822 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
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