Protein–RNA interactions for Protein: P35329

Cd22, B-cell receptor CD22, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd22P35329 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd22P35329 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd22P35329 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd22P35329 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd22P35329 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd22P35329 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd22P35329 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms