Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cd28P31041 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cd28P31041 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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