Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Psmb9P28076 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms