Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChgaP26339 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChgaP26339 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChgaP26339 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ChgaP26339 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ChgaP26339 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChgaP26339 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms