Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RhoP15409 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RhoP15409 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RhoP15409 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RhoP15409 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RhoP15409 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RhoP15409 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RhoP15409 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RhoP15409 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RhoP15409 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RhoP15409 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RhoP15409 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RhoP15409 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RhoP15409 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RhoP15409 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RhoP15409 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RhoP15409 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RhoP15409 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RhoP15409 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RhoP15409 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RhoP15409 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RhoP15409 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RhoP15409 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RhoP15409 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RhoP15409 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RhoP15409 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RhoP15409 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RhoP15409 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RhoP15409 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RhoP15409 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RhoP15409 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RhoP15409 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RhoP15409 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RhoP15409 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RhoP15409 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RhoP15409 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RhoP15409 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RhoP15409 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RhoP15409 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RhoP15409 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RhoP15409 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RhoP15409 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RhoP15409 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RhoP15409 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RhoP15409 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RhoP15409 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RhoP15409 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RhoP15409 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RhoP15409 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RhoP15409 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RhoP15409 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RhoP15409 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RhoP15409 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RhoP15409 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RhoP15409 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RhoP15409 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RhoP15409 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RhoP15409 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RhoP15409 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RhoP15409 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RhoP15409 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RhoP15409 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RhoP15409 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RhoP15409 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RhoP15409 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RhoP15409 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RhoP15409 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RhoP15409 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RhoP15409 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RhoP15409 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RhoP15409 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RhoP15409 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RhoP15409 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RhoP15409 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RhoP15409 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RhoP15409 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RhoP15409 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RhoP15409 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RhoP15409 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RhoP15409 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RhoP15409 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RhoP15409 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RhoP15409 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RhoP15409 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RhoP15409 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RhoP15409 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms