Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ccl2P10148 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms