Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CrygdP04342 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrygdP04342 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrygdP04342 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.84
CrygdP04342 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
CrygdP04342 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms