Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-Eb1P04230 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms