Protein–RNA interactions for Protein: P01662

Ig kappa chain V-III region ABPC 22/PC 9245, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01662 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01662 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01662 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P01662 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01662 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01662 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
P01662 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01662 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01662 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01662 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01662 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01662 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01662 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01662 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms