Protein–RNA interactions for Protein: P01643

Ig kappa chain V-V region MOPC 173, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01643 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01643 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01643 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01643 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01643 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01643 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P01643 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01643 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01643 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01643 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01643 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01643 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01643 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01643 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01643 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01643 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01643 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01643 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01643 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01643 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01643 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01643 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01643 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01643 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01643 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01643 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01643 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01643 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01643 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01643 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01643 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01643 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01643 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01643 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01643 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01643 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01643 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01643 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01643 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P01643 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms