Protein–RNA interactions for Protein: O88253

Gm10226, Mszf39 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10226O88253 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
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Gm10226O88253 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Gm10226O88253 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Gm10226O88253 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Gm10226O88253 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Gm10226O88253 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Gm10226O88253 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Gm10226O88253 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Gm10226O88253 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm10226O88253 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Gm10226O88253 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm10226O88253 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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