Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sdc4O35988 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sdc4O35988 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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