Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2O35245 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Pkd2O35245 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Pkd2O35245 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms