Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec22bO08547 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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