Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Gm2056J3QQ02 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Gm2056J3QQ02 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Gm2056J3QQ02 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm2056J3QQ02 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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