Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm5849J3QPE5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms