Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5294J3QP53 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm5294J3QP53 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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