Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm20795J3QP49 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms