Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS9

E030018B13Rik, RIKEN cDNA E030018B13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E030018B13RikJ3QMS9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
E030018B13RikJ3QMS9 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms