Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm11236J3QMS7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms