Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm6594J3QM43 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms