Protein–RNA interactions for Protein: J3QK59

Gm6176, Predicted gene 6176, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6176J3QK59 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Gm6176J3QK59 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Gm6176J3QK59 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Gm6176J3QK59 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Gm6176J3QK59 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Gm6176J3QK59 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Gm6176J3QK59 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Gm6176J3QK59 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Gm6176J3QK59 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Gm6176J3QK59 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Gm6176J3QK59 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm6176J3QK59 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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