Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gm21060J3KMU4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21060J3KMU4 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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