Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Speer4aF8VPX6 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms