Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm340F6RGI3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm340F6RGI3 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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