Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc85cE9Q6B2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms