Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ccdc175E9PVB3 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc175E9PVB3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms