Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rdh8D3Z6W3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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