Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms