Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Gm3543D3Z235 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm3543D3Z235 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm3543D3Z235 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm3543D3Z235 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm3543D3Z235 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm3543D3Z235 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm3543D3Z235 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm3543D3Z235 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm3543D3Z235 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm3543D3Z235 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm3543D3Z235 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
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Gm3543D3Z235 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3543D3Z235 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3543D3Z235 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
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