Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Ccdc6D3YZP9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Ccdc6D3YZP9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Ccdc6D3YZP9 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc6D3YZP9 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms