Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Usf3B2RUQ2 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Usf3B2RUQ2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Usf3B2RUQ2 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Usf3B2RUQ2 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Usf3B2RUQ2 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usf3B2RUQ2 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms