Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Spocd1B1ASB6 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Spocd1B1ASB6 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms