Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Samt1A2BED8 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Samt1A2BED8 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms