Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc183A2AJB1 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms