Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms