Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mbd3Q9Z2D8 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mbd3Q9Z2D8 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms