Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lgr5Q9Z1P4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms