Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Ccl8Q9Z121 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Ccl8Q9Z121 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl8Q9Z121 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms