Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms